Es muy importante ordenar nuestro código al momento de programar, y es por eso que a continuación pongo como hacer una auto-identación de código HTML y PHP en VIM:
Para código HTML:
:set ft=html #Cambia el tipo a HTML
=G #Identar todas las líneas
Para código HTML más PHP:
:set ft=phtml #Cambia el tipo a PHTML
=G #Identa todas las líneas
Fuente: http://stackoverflow.com/questions/459478/correct-indentation-of-html-and-php-using-vim